Ο αδόκητος χαμός του Γιάννη Χρήστου σε ηλικία μόλις 44 ετών και πάνω στη δημιουργική ακμή του συγκλόνισε τον μουσικό κόσμο. Τα πρώτα χρόνια μετά τον θάνατό του, οι συνεργάτες και συνοδοιπόροι του πραγματοποίησαν μια σειρά από αφιερώματα, παρουσιάσεις του έργου του, καθώς και πρώτες εκτελέσεις συνθέσεών του (Λατινική Λειτουργία, Συμφωνία αρ. 2, Τοκκάτα για πιάνο και ορχήστρα). Η μουσική του αγκαλιάστηκε από τα φεστιβάλ πρωτοποριακής μουσικής σε όλο τον κόσμο, ενώ όπως δείχνουν συνέδρια και πανεπιστημιακές εργασίες αποτελεί μέχρι σήμερα αντικείμενο ακαδημαϊκής έρευνας. Η έκδοση των τελευταίων έργων του έγινε εφικτή χάρη στην επιμέλεια και την αφοσίωση του μουσικού Νίκου Αυγέρη, στενού συνεργάτη του συνθέτη στην αποκρυπτογράφηση της ιδιόχειρης γραφικής σημειογραφίας και τη δημιουργία της εκάστοτε παρτιτούρας.
Στη μνήμη του Χρήστου συνέθεσαν έργα μουσικοί δημιουργοί όπως οι Giacinto Scelsi, Richard Felciano, Christian Wolff, Μίκης Θεοδωράκης, Νίκος Μαμαγκάκης, Στέφανος Βασιλειάδης, Μιχάλης Αδάμης, Δημήτρης Δραγατάκης, Γιώργος Κουρουπός κ.ά.
