Στο εκδοτικό πρόγραμμα του ΕΜΣΤ περιλαμβάνονται δίγλωσσοι (ελληνικά- αγγλικά) κατάλογοι των εκθέσεων, στους οποίους φιλοξενούνται θεωρητικά και κριτικά κείμενα ειδικών, καθώς και διακλαδικές ερμηνευτικές προσεγγίσεις από κοινωνιολόγους, ανθρωπολόγους, φιλοσόφους κ.ά. Εκδίδονται ακόμη ειδικά σχεδιασμένα εκπαιδευτικά έντυπα για το Δημοτικό και το Γυμνάσιο-Λύκειο, καθώς και έντυπα με τα νέα Αποκτήματα του Μουσείου. Προετοιμάζεται επίσης μια σειρά εκδόσεων με Κριτικά κείμενα πάνω στη σύγχρονη τέχνη, καθώς και μονογραφίες καλλιτεχνών με βάση ανέκδοτο υλικό του Αρχείου Ελλήνων Καλλιτεχνών.